（1）实验室整体布局：根据卫生部颁发的《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》（卫医发[2002]10号）要求，临床基因扩增检验室原则上分为四个单独的工作区域：试剂贮存和准备区，标本制备区，扩增区，产物分析区，也可以将后两个区域合为一个区，即扩增及产物分析区。实验室设计时按照《办法》规定，三个区域相互独立，并有各自的缓冲区域。
（2）各工作区域仪器设备各工作区域的仪器设备及物品，包括椅子、办公用品、清洁用品等均不能拿出本区域，所有可移动物品均应有本区域的标示。
各区域应具备的设备配置为：屋顶紫外灯、近台紫外灯、一次性手套、一次性鞋套、工作服、废液缸、扫帚、拖把、废纸篓、微量加样器（覆盖1-1000ul），经高压处理的离心管和加样器吸头（带滤芯）、笔、纸等。各工作区域的特殊配置包括：
（1）试剂贮存和准备区：2～8℃冰箱、漩涡震荡器、超净工作台。
（2）标本制备：2～8℃冰箱、-20℃冰箱、高速台式冷冻离心机、漩涡震荡器、金属加热模块、超净工作台。
（3）扩增及产物分析区：荧光定量核酸扩增仪、电脑、打印机。
同时：进入各工作区域必须严格按照单一流向，并用明显的箭头表示，各区域用不同的颜色以示区别。即试剂贮存和设备区（蓝色）→标本制备区（白色）→扩增及产物分析区（粉色）。